Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCMBPQ9BTE3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCMBPQ9BTE3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms