Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms