Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF559Q9BR84 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms