Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC77Q9BR77 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC77Q9BR77 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms