Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CITED1Q99966 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms