Protein–RNA interactions for Protein: Q99729

HNRNPAB, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPABQ99729 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPABQ99729 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPABQ99729 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms