Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAT1Q99536 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAT1Q99536 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms