Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms