Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAD1Q99259 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAD1Q99259 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAD1Q99259 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAD1Q99259 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAD1Q99259 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAD1Q99259 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GAD1Q99259 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAD1Q99259 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms