Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNKPQ96T60 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms