Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT8L2Q96SF2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT8L2Q96SF2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms