Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK1Q96SB4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPK1Q96SB4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms