Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERGIC2Q96RQ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERGIC2Q96RQ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms