Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85AQ96PX6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms