Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1Q96NA8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms