Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms