Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM227BQ96M60 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FAM227BQ96M60 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms