Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRC1Q96M27 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRC1Q96M27 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRRC1Q96M27 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRC1Q96M27 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRC1Q96M27 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRC1Q96M27 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRC1Q96M27 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRC1Q96M27 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRC1Q96M27 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms