Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM87BQ96K49 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 649.9 ms