Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEURL4Q96JN8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
NEURL4Q96JN8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEURL4Q96JN8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms