Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCMH1Q96GD3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCMH1Q96GD3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCMH1Q96GD3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCMH1Q96GD3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCMH1Q96GD3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCMH1Q96GD3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCMH1Q96GD3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCMH1Q96GD3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms