Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MED8Q96G25 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms