Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MFSD3Q96ES6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms