Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4CQ96DT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms