Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms