Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA6Q92908 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms