Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC3Q92529 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHC3Q92529 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHC3Q92529 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHC3Q92529 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC3Q92529 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC3Q92529 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC3Q92529 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC3Q92529 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC3Q92529 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC3Q92529 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms