Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCG3Q8WXD2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms