Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCA10Q8WWZ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA10Q8WWZ4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA10Q8WWZ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms