Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA3Q8TBC4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms