Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD1Q8NHV4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms