Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL11Q8NHH1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms