Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC148Q8NFR7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms