Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00301Q8NCQ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00301Q8NCQ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms