Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM1BQ8NB78 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms