Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNLDC1Q8NA58 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PNLDC1Q8NA58 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms