Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR7Q8N806 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR7Q8N806 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms