Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC24Q8N4L8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms