Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC47Q8N1G4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC47Q8N1G4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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