Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACE1Q8IYU2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms