Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms