Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms