Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL3Q8IVW4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms