Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms