Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms