Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLASP1Q7Z460 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLASP1Q7Z460 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLASP1Q7Z460 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms