Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD4Q7Z3J3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms