Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms