Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPER4Q7RTX7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CATSPER4Q7RTX7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms