Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPS6Q7L5N1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPS6Q7L5N1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms